Dengan suatu tekad yang kuat dalam membangun anak bangsa yang mampu menjawab permasalahan dimasa mendatang didirikanlah Pondok Pesantren Al-Mawaddah Ciganjur tahun 2000, dibawah naungan yayasan baitul rahim ciganjur. Pesantren ini mengelola pendidikan untuk tingkat Madrasah Tsanawiyah (MTs), setingkat SMP dan Madrasah Aliyah (MA) sederajat dengan SMA. Kurikulum yang digunakan mengacu kepada kurikulum Agama, Kementerian Pendidikan Nasional, Pondok Modern & Pondok Salafiyah.